Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG9

AAAS, Aladin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAASQ9NRG9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AAASQ9NRG9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AAASQ9NRG9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AAASQ9NRG9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AAASQ9NRG9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
AAASQ9NRG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AAASQ9NRG9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AAASQ9NRG9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AAASQ9NRG9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AAASQ9NRG9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AAASQ9NRG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AAASQ9NRG9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AAASQ9NRG9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AAASQ9NRG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms