Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
MYO5CQ9NQX4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
MYO5CQ9NQX4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.52■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.52■■■■■ 4.24
MYO5CQ9NQX4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
MYO5CQ9NQX4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
MYO5CQ9NQX4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
MYO5CQ9NQX4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
MYO5CQ9NQX4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
MYO5CQ9NQX4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
MYO5CQ9NQX4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
MYO5CQ9NQX4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
MYO5CQ9NQX4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
MYO5CQ9NQX4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
MYO5CQ9NQX4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
MYO5CQ9NQX4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
MYO5CQ9NQX4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
MYO5CQ9NQX4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
MYO5CQ9NQX4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
MYO5CQ9NQX4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
MYO5CQ9NQX4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
MYO5CQ9NQX4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
MYO5CQ9NQX4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
MYO5CQ9NQX4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
MYO5CQ9NQX4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
MYO5CQ9NQX4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
MYO5CQ9NQX4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
MYO5CQ9NQX4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
MYO5CQ9NQX4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
MYO5CQ9NQX4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
MYO5CQ9NQX4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms