Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN3Q9NQS3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NECTIN3Q9NQS3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NECTIN3Q9NQS3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN3Q9NQS3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECTIN3Q9NQS3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECTIN3Q9NQS3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN3Q9NQS3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECTIN3Q9NQS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NECTIN3Q9NQS3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN3Q9NQS3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN3Q9NQS3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms