Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC177Q9NQR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC177Q9NQR7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC177Q9NQR7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC177Q9NQR7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC177Q9NQR7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC177Q9NQR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms