Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKKSQ9NPJ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKKSQ9NPJ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKKSQ9NPJ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKKSQ9NPJ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKKSQ9NPJ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms