Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREM1Q9NP99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM1Q9NP99 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREM1Q9NP99 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREM1Q9NP99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms