Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PALMDQ9NP74 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMDQ9NP74 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMDQ9NP74 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMDQ9NP74 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALMDQ9NP74 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms