Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB18Q9NP72 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB18Q9NP72 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB18Q9NP72 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB18Q9NP72 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms