Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN10Q9HC96 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN10Q9HC96 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN10Q9HC96 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN10Q9HC96 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN10Q9HC96 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN10Q9HC96 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN10Q9HC96 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN10Q9HC96 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN10Q9HC96 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN10Q9HC96 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms