Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SUGCTQ9HAC7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SUGCTQ9HAC7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUGCTQ9HAC7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUGCTQ9HAC7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUGCTQ9HAC7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUGCTQ9HAC7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SUGCTQ9HAC7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SUGCTQ9HAC7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SUGCTQ9HAC7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SUGCTQ9HAC7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms