Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCLRE1BQ9H816 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCLRE1BQ9H816 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLRE1BQ9H816 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DCLRE1BQ9H816 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCLRE1BQ9H816 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCLRE1BQ9H816 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCLRE1BQ9H816 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms