Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRDE2Q9H7Z3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRDE2Q9H7Z3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRDE2Q9H7Z3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NRDE2Q9H7Z3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRDE2Q9H7Z3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NRDE2Q9H7Z3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRDE2Q9H7Z3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms