Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC4Q9H6D8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC4Q9H6D8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC4Q9H6D8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FNDC4Q9H6D8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FNDC4Q9H6D8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FNDC4Q9H6D8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC4Q9H6D8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNDC4Q9H6D8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FNDC4Q9H6D8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms