Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P2

NELFA, Negative elongation factor A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFAQ9H3P2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFAQ9H3P2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFAQ9H3P2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFAQ9H3P2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFAQ9H3P2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFAQ9H3P2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFAQ9H3P2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFAQ9H3P2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFAQ9H3P2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms