Protein–RNA interactions for Protein: Q9H257

CARD9, Caspase recruitment domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD9Q9H257 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARD9Q9H257 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD9Q9H257 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD9Q9H257 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD9Q9H257 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD9Q9H257 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD9Q9H257 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD9Q9H257 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARD9Q9H257 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARD9Q9H257 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARD9Q9H257 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARD9Q9H257 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARD9Q9H257 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARD9Q9H257 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CARD9Q9H257 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARD9Q9H257 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms