Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1EQ9GZS1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1EQ9GZS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1EQ9GZS1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1EQ9GZS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1EQ9GZS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms