Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
B3GNT4Q9C0J1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B3GNT4Q9C0J1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B3GNT4Q9C0J1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B3GNT4Q9C0J1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
B3GNT4Q9C0J1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms