Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM8Q9BZR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM8Q9BZR9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM8Q9BZR9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM8Q9BZR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM8Q9BZR9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM8Q9BZR9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms