Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCAR1Q9BXC0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HCAR1Q9BXC0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HCAR1Q9BXC0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCAR1Q9BXC0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCAR1Q9BXC0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HCAR1Q9BXC0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HCAR1Q9BXC0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms