Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP58Q9BVL2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP58Q9BVL2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP58Q9BVL2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP58Q9BVL2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP58Q9BVL2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP58Q9BVL2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP58Q9BVL2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP58Q9BVL2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP58Q9BVL2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP58Q9BVL2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP58Q9BVL2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP58Q9BVL2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP58Q9BVL2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms