Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THUMPD3Q9BV44 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD3Q9BV44 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THUMPD3Q9BV44 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THUMPD3Q9BV44 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD3Q9BV44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THUMPD3Q9BV44 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
THUMPD3Q9BV44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms