Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL8

PDCD10, Programmed cell death protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD10Q9BUL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD10Q9BUL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD10Q9BUL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD10Q9BUL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD10Q9BUL8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD10Q9BUL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms