Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSG1Q9BU20 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSG1Q9BU20 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSG1Q9BU20 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSG1Q9BU20 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms