Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDHD3Q9BSH5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDHD3Q9BSH5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDHD3Q9BSH5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDHD3Q9BSH5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDHD3Q9BSH5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 631.2 ms