Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NICN1Q9BSH3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NICN1Q9BSH3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NICN1Q9BSH3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NICN1Q9BSH3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NICN1Q9BSH3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms