Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG5

RTBDN, Retbindin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTBDNQ9BSG5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTBDNQ9BSG5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTBDNQ9BSG5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTBDNQ9BSG5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTBDNQ9BSG5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTBDNQ9BSG5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTBDNQ9BSG5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTBDNQ9BSG5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTBDNQ9BSG5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTBDNQ9BSG5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTBDNQ9BSG5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RTBDNQ9BSG5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTBDNQ9BSG5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms