Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG101Q9BSB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG101Q9BSB4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG101Q9BSB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG101Q9BSB4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms