Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP23Q9BRU9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTP23Q9BRU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP23Q9BRU9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP23Q9BRU9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP23Q9BRU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP23Q9BRU9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms