Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPGQ9BPX3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPGQ9BPX3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPGQ9BPX3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPGQ9BPX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPGQ9BPX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPGQ9BPX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms