Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL4Q9BPW4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL4Q9BPW4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOL4Q9BPW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL4Q9BPW4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL4Q9BPW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOL4Q9BPW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOL4Q9BPW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms