Protein–RNA interactions for Protein: Q99853

FOXB1, Forkhead box protein B1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB1Q99853 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB1Q99853 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB1Q99853 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXB1Q99853 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXB1Q99853 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB1Q99853 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms