Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC38A3Q99624 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC38A3Q99624 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A3Q99624 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC38A3Q99624 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC38A3Q99624 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A3Q99624 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms