Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SECISBP2Q96T21 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SECISBP2Q96T21 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SECISBP2Q96T21 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SECISBP2Q96T21 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms