Protein–RNA interactions for Protein: Q96SE7

ZNF347, Zinc finger protein 347, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF347Q96SE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF347Q96SE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF347Q96SE7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF347Q96SE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF347Q96SE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF347Q96SE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF347Q96SE7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF347Q96SE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF347Q96SE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF347Q96SE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF347Q96SE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF347Q96SE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms