Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDCD1Q96RS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUDCD1Q96RS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCD1Q96RS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUDCD1Q96RS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUDCD1Q96RS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NUDCD1Q96RS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms