Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GAL3ST4Q96RP7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAL3ST4Q96RP7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GAL3ST4Q96RP7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GAL3ST4Q96RP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAL3ST4Q96RP7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms