Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CICQ96RK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CICQ96RK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CICQ96RK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CICQ96RK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CICQ96RK0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CICQ96RK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CICQ96RK0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CICQ96RK0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CICQ96RK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CICQ96RK0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CICQ96RK0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CICQ96RK0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CICQ96RK0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CICQ96RK0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CICQ96RK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CICQ96RK0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms