Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF13CQ96RJ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF13CQ96RJ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF13CQ96RJ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms