Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX1Q96RD7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX1Q96RD7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX1Q96RD7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX1Q96RD7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX1Q96RD7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PANX1Q96RD7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PANX1Q96RD7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANX1Q96RD7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANX1Q96RD7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PANX1Q96RD7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PANX1Q96RD7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms