Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF48Q96MX3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF48Q96MX3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF48Q96MX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF48Q96MX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF48Q96MX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms