Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNDP1Q96KN2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNDP1Q96KN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNDP1Q96KN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNDP1Q96KN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNDP1Q96KN2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CNDP1Q96KN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNDP1Q96KN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms