Protein–RNA interactions for Protein: Q96JZ2

HSH2D, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSH2DQ96JZ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSH2DQ96JZ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSH2DQ96JZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSH2DQ96JZ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSH2DQ96JZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSH2DQ96JZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSH2DQ96JZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSH2DQ96JZ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSH2DQ96JZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSH2DQ96JZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms