Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHAMP1Q96JM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAMP1Q96JM3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHAMP1Q96JM3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHAMP1Q96JM3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CHAMP1Q96JM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHAMP1Q96JM3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHAMP1Q96JM3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHAMP1Q96JM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms