Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPD52L3Q96J77 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPD52L3Q96J77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPD52L3Q96J77 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPD52L3Q96J77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPD52L3Q96J77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 330.9 ms