Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZBED3Q96IU2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ZBED3Q96IU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZBED3Q96IU2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZBED3Q96IU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED3Q96IU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZBED3Q96IU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZBED3Q96IU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED3Q96IU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED3Q96IU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED3Q96IU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED3Q96IU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED3Q96IU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
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