Protein–RNA interactions for Protein: Q96I45

TMEM141, Transmembrane protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM141Q96I45 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM141Q96I45 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM141Q96I45 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM141Q96I45 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM141Q96I45 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM141Q96I45 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM141Q96I45 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM141Q96I45 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM141Q96I45 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM141Q96I45 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM141Q96I45 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM141Q96I45 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM141Q96I45 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms