Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGSM3Q96HU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGSM3Q96HU1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SGSM3Q96HU1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGSM3Q96HU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGSM3Q96HU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM3Q96HU1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms