Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BORCS6Q96GS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BORCS6Q96GS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BORCS6Q96GS4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BORCS6Q96GS4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BORCS6Q96GS4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BORCS6Q96GS4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms