Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD4

AURKB, Aurora kinase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKBQ96GD4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AURKBQ96GD4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AURKBQ96GD4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AURKBQ96GD4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AURKBQ96GD4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AURKBQ96GD4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AURKBQ96GD4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AURKBQ96GD4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AURKBQ96GD4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AURKBQ96GD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AURKBQ96GD4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AURKBQ96GD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AURKBQ96GD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AURKBQ96GD4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKBQ96GD4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms