Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BICD1Q96G01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BICD1Q96G01 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BICD1Q96G01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BICD1Q96G01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BICD1Q96G01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BICD1Q96G01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms